南栗橋車両管理区南栗橋本区は1986年に春日部検修区の留置線として作られました。その後2003年3月19日の組織改正で南栗橋検修区に、2004年4月の組織改正によって南栗橋車両管理区南栗橋本区となり、2009年10月に南栗橋車両管区南栗橋本区となりました。2023年3月18日に新栃木出張所を統合し、同出張所所属車が転入しました。
半蔵門線直通用車両が所属するほか春日部支所の車両の留置もあります。2013年11月からは波動用の1800系、2017年4月からは634型スカイツリートレインも所属しています。なお1800系は2018年6月に廃車となりました。2020年6月には350型が転入しましたが、2022年7月に全廃となりました。