ED79形は青函トンネル対応設備を装備した津軽海峡線専用機関車としてED75形700番台から改造されました。
多湿の青函トンネルに備えて絶縁の強化や回生ブレーキの追加、ATC-L型の搭載などが行われています。1986年から88年に改造が行われ、0番代21両と青森側のATCと回生ブレーキを省き補機専用とした100番台13両が登場しました。
快速海峡や各種寝台特急、貨物列車の牽引で活躍しましたが、2002年12月に789系が投入されたことに伴い快速海峡が廃止、2006年3月にはEH500形の増備に伴いJR貨物からの運用受託が解消されたことに伴い廃車が進みました。2016年3月26日に北海道新幹線が開業したことにより全車離脱し、廃車となりました。